Bz-rC Phosphoramidit

Bz-rC Phosphoramidit er en fundamental monomer til den kemiske syntese af RNA-oligonukleotider. N4-benzoyl-beskyttelsesgruppen på cytosinbasen forhindrer forgrening og kædeterminering under phosphoramidit-koblingscyklussen, mens 2'-O-TBDMS-gruppen beskytter 2'-hydroxylen gennem hele kædesamlingen og fjernes efter syntese ved hjælp af fluorid-baserede reagenser såsom triethylamin trihydrofluorid (TEA-HF). Bz-rC Phosphoramidite er kompatibel med standard RNA-synteseprotokoller på automatiserede DNA/RNA-synthesizere (f.eks. Applied Biosystems, MerMade, Dr. Oligo), typisk ved brug af 0,25 M aktivatoropløsninger (5-ethylthio-1H-tetrazol, 4,5-coupling gange dicanoimidazol) og 4,5 5-10 minutter. Bz-rC Phosphoramidit er blevet omfattende valideret i syntesen af ​​RNA til strukturelle undersøgelser, antisense-oligonukleotider, siRNA og aptamerer. Bz-rC Phosphoramidit bruges også som referencestandard i oligonukleotid-urenhedsprofilering, da benzoylgruppen kan give anledning til karakteristiske biprodukter (f.eks. N4-benzoyl-depyrimidineringsprodukter), som skal overvåges under procesudvikling.

Produktparametre

Kvalitetssikring hos Cosperpharm

Hver batch gennemgår:

● Gaschromatografi (GC) – renhed ≥97,0 %

● Ikke-vandig titrering – renhed ≥97,0 %

● Brydningsindeks – bekræftende analyse

● ¹H NMR – strukturel verifikation

● Udseende – farveløs til lys gul til lys orange klar væske

Et omfattende COA, MSDS (med fuld GHS-information) og oprindelsescertifikat ledsager hver forsendelse.

FAQ

Q1: Hvad er forskellen mellem Bz-rC Phosphoramidite og Ac-rC Phosphoramidite?

A: Bz-rC Phosphoramidit bruger en benzoyl (Bz) beskyttende gruppe på den N4 exocykliske amin af cytosin, mens Ac-rC bruger en acetyl (Ac) gruppe. Benzoylgruppen giver større beskyttelse mod depyrimidinering under de sure betingelser for DMT-fjernelse (3% trichloreddikesyre i dichlormethan). Til de fleste RNA-synteseapplikationer foretrækkes benzoylgruppen til lange eller deoxycytidinrige sekvenser.

Q2: Hvad er den anbefalede koblingstid for Bz-rC Phosphoramidite på en standard synthesizer?

A: Under standard RNA-syntesebetingelser med 0,25 M aktivator (f.eks. 5-ethylthio-1H-tetrazol eller 4,5-dicyanoimidazol), er en koblingstid på 5-10 minutter typisk for Bz-rC Phosphoramidit. For længere oligonukleotider (>40-mer) eller høj-throughput-syntese kan optimering af aktivatorkoncentration og koblingstid forbedre udbyttet.

Produktapplikationsscenarier

1.RNA-oligonukleotidsyntese

Bz-rC Phosphoramidite er standardbyggestenen til at introducere cytidinrester i syntetiske RNA-oligonukleotider til forskning, diagnostik og terapeutisk udvikling.

2.siRNA Fremstilling

Bruges til at inkorporere 2'-OH-cytidin i siRNA-duplekser. TBDMS-gruppen fjernes efter syntese, hvilket giver fuldt naturligt RNA til RNAi-undersøgelser.

3. Antisense oligonukleotid (ASO) syntese

ASO'er rettet mod RNA-transkripter kræver RNA-segmenter (f.eks. i gapmer-design). Bz-rC Phosphoramidite forsyner de nødvendige cytidinrester med fuld nukleaseresistens, når de efterlades som 2'-OH eller modificeret.

4.RNA Aptamer Generation

Aptamer-biblioteker og individuelle aptamer-kandidater syntetiseres kemisk ved hjælp af Bz-rC Phosphoramidite for at sikre sekvenstroskab og skalerbarhed.

5. Strukturel biologi RNA-forberedelse

Til røntgenkrystallografi og NMR-undersøgelser skal veldefinerede RNA-sekvenser syntetiseres med høj renhed. Bz-rC Phosphoramidit leverer den påkrævede koblingseffektivitet og afbeskyttelsesrenhed.

6.Referencestandard for urenhedsprofilering

Som en potentiel procesurenhed i oligonukleotidlægemiddelstoffer (f.eks. resterende N4-benzoyl-cytidin, ufuldstændige afbeskyttelsesprodukter), tjener Bz-rC Phosphoramidit eller dets afbeskyttede derivater som referencestandarder i HPLC- og LC-MS-metoder.

Kontakt os

Klar til at bestille Bz-rC Phosphoramidite til dit næste RNA-synteseprojekt? Cosperpharms team står klar til at diskutere dine renhedskrav, dokumentationsbehov og leveringstidslinjer.